秦皇岛军工医院前身为中国人民解放军总后勤部第六职工医院，始建于1970年。2003年由军队移交秦皇岛市政府。医院位于秦皇岛市海港区燕山大街西段，东面是原市委党校，西有高速公路管理处，南靠燕山大街，北面是第十六中学、第五中学，在海港区北环路街道办事处所辖区域内，距秦皇岛火车站1.9公里。院区1至6栋楼房由南到北分布，一栋三层门诊楼紧靠燕山大街，其余5栋分别用于10个病区、医技楼、体检楼、教学实习楼等，占地近50亩，建筑面积27000多平米。秦皇岛军工医院经过近50年的发展，已经成为一所具有一定规模的，集医教研于一体的公立综合性二级甲等医院，是秦皇岛市各县区医疗保险定点医院。

秦皇岛军工医院配有可升降流水康复训练池。